1.市局机关内设机构设置

（1）办公室

（2）业务科（人影办、气象学会）

（3）人事教育科（党建办、文明办）

2.市局直属事业单位设置

（1）玉林市气象台

（2）玉林市气象探测中心

（3）玉林市气象科技服务中心

（4）财务服务中心（审计室）

（5）玉林市气象信息与技术保障中心

3.地方机构

玉林市气象防灾减灾中心 

4.下辖4个县（市）气象局

北流市气象局、容县气象局、博白县气象局、陆川县气象局